Методы компьютерного моделирования для разработки новых лекарственных препаратов против ВИЧ-1

В последнее десятилетие в процессе создания новых лекарственных препаратов возрастает роль методов компьютерного молекулярного моделирования, позволяющих значительно сократить сроки разработки лекарств и существенно уменьшить финансовые расходы [1]. С помощью этих методов нами были сконструированы трехмерные структуры мишени ВИЧ 1 – петли V3 белка gp120, ее потенциальные лиганды – «водо­растворимые» аналоги гликолипида -галактозилцерамида ( -GalCer), построены их структурные комплексы и проанализированы типы межмолекулярных взаимодействий, стабилизирующих комплексы, а также рассчитаны свободные энергии их образования. В результате были идентифицированы гликолипиды, которые могут рассматриваться как первоочередные кандидаты на роль ингибиторов проникновения ВИЧ 1 с широкой вирусной нейтрализацией для их последующего химического синтеза и тестирования на анти-ВИЧ активность.